Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用
Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用
本包用于支持核酸检测分析,主要面向科学家。
使用方法
以下是一个简单的示例,展示如何使用nucleic_acid
插件进行基因序列操作。
import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';
void main() async {
// 定义一个基因序列
NucleotideSequence gene = NucleotideSequence("attgac");
// 获取互补链(DNA模板链)
NucleotideSequence templateDNA = gene.complemented(EnumNucleotideSequenceType.dna);
// 转录(生成mRNA)
NucleotideSequence mRNA = gene.converted(EnumNucleotideSequenceType.rna);
NucleotideSequence tRNA = mRNA.complemented(EnumNucleotideSequenceType.rna);
// 翻译(生成肽链)
AminoAcidSequence peptide = AminoAcidSequence(mRNA);
// 直接从DNA翻译生成肽链
AminoAcidSequence peptideFromDNA = AminoAcidSequence(gene);
// 序列扩展
// 合并两个相同序列
NucleotideSequence gene2 = gene + gene; // 结果为 "attgacattgac"
// 合并原序列与反转序列
NucleotideSequence gene3 = gene + gene.reversed(); // 结果为 "attgaccagtta"
// 添加反转序列到原序列
gene.add(gene.reversed(), useDirection: true); // 结果为 "attgacattgac"
// 深度复制序列
NucleotideSequence geneCopy = gene.deepCopy();
// 获取子序列
NucleotideSequence gac = NucleotideSequence("attgac").subSeq(3); // 结果为 "gac"
}
文件格式转换
可以将序列数据转换为FASTA格式,并读取FASTA文件。
// 创建FASTA格式字符串
String fastaContent = '>sequence1\n';
fastaContent += 'ATGCAGTAGCTAGCTACGT\n';
fastaContent += '>sequence2\n';
fastaContent += 'CGTAGCTAGCTAGCATCGT\n';
// 将FASTA字符串解析为NucleotideSequence对象列表
List<NucleotideSequence> nSeq = UtilFasta.read(fastaContent);
// 将NucleotideSequence对象重新转换为FASTA格式
String reConvertFasta = UtilFasta.write(nSeq[0], "sequence1");
数组搜索
可以在序列中查找特定模式的位置。
// 查找EcoRI限制性内切酶位点的位置
final NucleotideSequence seq =
NucleotideSequence('ATGAATTCAGAATTCTATATATATATACC'.toLowerCase());
final NucleotideSequence ecoRI = NucleotideSequence('GAATTC'.toLowerCase());
// 获取位置索引 [2, 9]
List<int> ecoRIPositions = UtilNucleotideSearch.getPositions(seq, ecoRI, true);
// 模糊匹配查找
final NucleotideSequence fuzzyEcoRI = NucleotideSequence('GNMTTC'.toLowerCase());
// 获取位置索引 [2, 9]
List<int> ecoRIPositions2 = UtilNucleotideSearch.getPositions(seq, fuzzyEcoRI, true, fuzzyComp: true);
// 查找串联重复序列
// 获取重复起始和结束位置 [[15, 27]]
List<List<int>> tRepeats = UtilNucleotideSearch.tandemRepeat(seq, 2, 2, true);
// 对氨基酸序列进行类似的搜索
AminoAcidSequence aaSeq = AminoAcidSequence.fromStr("MVWWLALALAANYY");
AminoAcidSequence target = AminoAcidSequence.fromStr("LXLXLXXN");
// 获取位置索引 [4]
List<int> tPositions = UtilAminoAcidSearch.getPositions(aaSeq, target, true, fuzzyComp: true);
数据结构说明
NucleotideSequence 类
class NucleotideSequence {
List<Nucleotide> sequence; // 序列列表
EnumNucleotideSequenceType type; // DNA或RNA类型
EnumNucleotideSequenceDirection direction; // 序列方向
String? id; // 序列ID
String? description; // 描述
Map<String, dynamic>? info; // 其他信息
Map<String, NucleotideInfo>? nucleotideInfo; // 核苷酸详细信息
}
AminoAcidSequence 类
class AminoAcidSequence {
List<AminoAcid> sequence; // 氨基酸序列列表
EnumAminoAcidSequenceDirection direction; // 序列方向
String? id; // 序列ID
String? description; // 描述
Map<String, dynamic>? info; // 其他信息
Map<String, AminoAcidInfo>? aminoAcidInfo; // 氨基酸详细信息
}
更多关于Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用的实战教程也可以访问 https://www.itying.com/category-92-b0.html
更多关于Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用的实战系列教程也可以访问 https://www.itying.com/category-92-b0.html
nucleic_acid
是一个用于在 Flutter 应用中集成核酸检测功能的插件。它可以帮助开发者快速实现核酸检测相关的功能,如预约、查询结果等。以下是如何使用 nucleic_acid
插件的基本步骤:
1. 添加依赖
首先,你需要在 pubspec.yaml
文件中添加 nucleic_acid
插件的依赖:
dependencies:
flutter:
sdk: flutter
nucleic_acid: ^1.0.0 # 请使用最新版本
然后运行 flutter pub get
来获取依赖。
2. 导入插件
在你的 Dart 文件中导入 nucleic_acid
插件:
import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';
3. 初始化插件
在使用插件之前,通常需要先进行初始化。你可以在 main.dart
或任何合适的地方进行初始化:
void main() async {
WidgetsFlutterBinding.ensureInitialized();
await NucleicAcid.initialize();
runApp(MyApp());
}
4. 使用插件功能
nucleic_acid
插件提供了多种功能,以下是一些常见的使用示例:
4.1 预约核酸检测
void bookNucleicAcidTest() async {
try {
var result = await NucleicAcid.bookTest(
name: '张三',
idCard: '123456789012345678',
phone: '13800138000',
location: '北京市朝阳区',
date: DateTime.now().add(Duration(days: 1)),
);
print('预约成功: $result');
} catch (e) {
print('预约失败: $e');
}
}
4.2 查询核酸检测结果
void queryNucleicAcidResult() async {
try {
var result = await NucleicAcid.queryResult(
idCard: '123456789012345678',
phone: '13800138000',
);
print('查询结果: $result');
} catch (e) {
print('查询失败: $e');
}
}
4.3 取消预约
void cancelNucleicAcidTest() async {
try {
var result = await NucleicAcid.cancelTest(
bookingId: '123456',
);
print('取消成功: $result');
} catch (e) {
print('取消失败: $e');
}
}
5. 处理权限
某些功能可能需要特定的权限,例如访问网络或读取设备信息。确保在 AndroidManifest.xml
和 Info.plist
中添加必要的权限声明。
6. 错误处理
在使用插件时,可能会遇到各种错误,如网络问题、权限问题等。确保在调用插件方法时进行适当的错误处理。
7. 示例应用
以下是一个简单的示例应用,展示了如何使用 nucleic_acid
插件进行核酸检测预约和查询:
import 'package:flutter/material.dart';
import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';
void main() async {
WidgetsFlutterBinding.ensureInitialized();
await NucleicAcid.initialize();
runApp(MyApp());
}
class MyApp extends StatelessWidget {
[@override](/user/override)
Widget build(BuildContext context) {
return MaterialApp(
home: Scaffold(
appBar: AppBar(
title: Text('核酸检测插件示例'),
),
body: Center(
child: Column(
mainAxisAlignment: MainAxisAlignment.center,
children: [
ElevatedButton(
onPressed: () {
bookNucleicAcidTest();
},
child: Text('预约核酸检测'),
),
SizedBox(height: 20),
ElevatedButton(
onPressed: () {
queryNucleicAcidResult();
},
child: Text('查询核酸检测结果'),
),
],
),
),
),
);
}
void bookNucleicAcidTest() async {
try {
var result = await NucleicAcid.bookTest(
name: '张三',
idCard: '123456789012345678',
phone: '13800138000',
location: '北京市朝阳区',
date: DateTime.now().add(Duration(days: 1)),
);
print('预约成功: $result');
} catch (e) {
print('预约失败: $e');
}
}
void queryNucleicAcidResult() async {
try {
var result = await NucleicAcid.queryResult(
idCard: '123456789012345678',
phone: '13800138000',
);
print('查询结果: $result');
} catch (e) {
print('查询失败: $e');
}
}
}