Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用

Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用

本包用于支持核酸检测分析,主要面向科学家。

使用方法

以下是一个简单的示例,展示如何使用nucleic_acid插件进行基因序列操作。

import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';

void main() async {
  // 定义一个基因序列
  NucleotideSequence gene = NucleotideSequence("attgac");

  // 获取互补链(DNA模板链)
  NucleotideSequence templateDNA = gene.complemented(EnumNucleotideSequenceType.dna);

  // 转录(生成mRNA)
  NucleotideSequence mRNA = gene.converted(EnumNucleotideSequenceType.rna);
  NucleotideSequence tRNA = mRNA.complemented(EnumNucleotideSequenceType.rna);

  // 翻译(生成肽链)
  AminoAcidSequence peptide = AminoAcidSequence(mRNA);

  // 直接从DNA翻译生成肽链
  AminoAcidSequence peptideFromDNA = AminoAcidSequence(gene);

  // 序列扩展
  // 合并两个相同序列
  NucleotideSequence gene2 = gene + gene; // 结果为 "attgacattgac"
  // 合并原序列与反转序列
  NucleotideSequence gene3 = gene + gene.reversed(); // 结果为 "attgaccagtta"

  // 添加反转序列到原序列
  gene.add(gene.reversed(), useDirection: true); // 结果为 "attgacattgac"

  // 深度复制序列
  NucleotideSequence geneCopy = gene.deepCopy();

  // 获取子序列
  NucleotideSequence gac = NucleotideSequence("attgac").subSeq(3); // 结果为 "gac"
}

文件格式转换

可以将序列数据转换为FASTA格式,并读取FASTA文件。

// 创建FASTA格式字符串
String fastaContent = '>sequence1\n';
fastaContent += 'ATGCAGTAGCTAGCTACGT\n';
fastaContent += '>sequence2\n';
fastaContent += 'CGTAGCTAGCTAGCATCGT\n';

// 将FASTA字符串解析为NucleotideSequence对象列表
List<NucleotideSequence> nSeq = UtilFasta.read(fastaContent);

// 将NucleotideSequence对象重新转换为FASTA格式
String reConvertFasta = UtilFasta.write(nSeq[0], "sequence1");

数组搜索

可以在序列中查找特定模式的位置。

// 查找EcoRI限制性内切酶位点的位置
final NucleotideSequence seq =
    NucleotideSequence('ATGAATTCAGAATTCTATATATATATACC'.toLowerCase());
final NucleotideSequence ecoRI = NucleotideSequence('GAATTC'.toLowerCase());

// 获取位置索引 [2, 9]
List<int> ecoRIPositions = UtilNucleotideSearch.getPositions(seq, ecoRI, true);

// 模糊匹配查找
final NucleotideSequence fuzzyEcoRI = NucleotideSequence('GNMTTC'.toLowerCase());
// 获取位置索引 [2, 9]
List<int> ecoRIPositions2 = UtilNucleotideSearch.getPositions(seq, fuzzyEcoRI, true, fuzzyComp: true);

// 查找串联重复序列
// 获取重复起始和结束位置 [[15, 27]]
List<List<int>> tRepeats = UtilNucleotideSearch.tandemRepeat(seq, 2, 2, true);

// 对氨基酸序列进行类似的搜索
AminoAcidSequence aaSeq = AminoAcidSequence.fromStr("MVWWLALALAANYY");
AminoAcidSequence target = AminoAcidSequence.fromStr("LXLXLXXN");
// 获取位置索引 [4]
List<int> tPositions = UtilAminoAcidSearch.getPositions(aaSeq, target, true, fuzzyComp: true);

数据结构说明

NucleotideSequence 类

class NucleotideSequence {
  List<Nucleotide> sequence; // 序列列表
  EnumNucleotideSequenceType type; // DNA或RNA类型
  EnumNucleotideSequenceDirection direction; // 序列方向
  String? id; // 序列ID
  String? description; // 描述
  Map<String, dynamic>? info; // 其他信息
  Map<String, NucleotideInfo>? nucleotideInfo; // 核苷酸详细信息
}

AminoAcidSequence 类

class AminoAcidSequence {
  List<AminoAcid> sequence; // 氨基酸序列列表
  EnumAminoAcidSequenceDirection direction; // 序列方向
  String? id; // 序列ID
  String? description; // 描述
  Map<String, dynamic>? info; // 其他信息
  Map<String, AminoAcidInfo>? aminoAcidInfo; // 氨基酸详细信息
}

更多关于Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用的实战教程也可以访问 https://www.itying.com/category-92-b0.html

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更多关于Flutter核酸检测插件nucleic_acid的使用的实战系列教程也可以访问 https://www.itying.com/category-92-b0.html


nucleic_acid 是一个用于在 Flutter 应用中集成核酸检测功能的插件。它可以帮助开发者快速实现核酸检测相关的功能,如预约、查询结果等。以下是如何使用 nucleic_acid 插件的基本步骤:

1. 添加依赖

首先,你需要在 pubspec.yaml 文件中添加 nucleic_acid 插件的依赖:

dependencies:
  flutter:
    sdk: flutter
  nucleic_acid: ^1.0.0  # 请使用最新版本

然后运行 flutter pub get 来获取依赖。

2. 导入插件

在你的 Dart 文件中导入 nucleic_acid 插件:

import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';

3. 初始化插件

在使用插件之前,通常需要先进行初始化。你可以在 main.dart 或任何合适的地方进行初始化:

void main() async {
  WidgetsFlutterBinding.ensureInitialized();
  await NucleicAcid.initialize();
  runApp(MyApp());
}

4. 使用插件功能

nucleic_acid 插件提供了多种功能,以下是一些常见的使用示例:

4.1 预约核酸检测

void bookNucleicAcidTest() async {
  try {
    var result = await NucleicAcid.bookTest(
      name: '张三',
      idCard: '123456789012345678',
      phone: '13800138000',
      location: '北京市朝阳区',
      date: DateTime.now().add(Duration(days: 1)),
    );
    print('预约成功: $result');
  } catch (e) {
    print('预约失败: $e');
  }
}

4.2 查询核酸检测结果

void queryNucleicAcidResult() async {
  try {
    var result = await NucleicAcid.queryResult(
      idCard: '123456789012345678',
      phone: '13800138000',
    );
    print('查询结果: $result');
  } catch (e) {
    print('查询失败: $e');
  }
}

4.3 取消预约

void cancelNucleicAcidTest() async {
  try {
    var result = await NucleicAcid.cancelTest(
      bookingId: '123456',
    );
    print('取消成功: $result');
  } catch (e) {
    print('取消失败: $e');
  }
}

5. 处理权限

某些功能可能需要特定的权限,例如访问网络或读取设备信息。确保在 AndroidManifest.xmlInfo.plist 中添加必要的权限声明。

6. 错误处理

在使用插件时,可能会遇到各种错误,如网络问题、权限问题等。确保在调用插件方法时进行适当的错误处理。

7. 示例应用

以下是一个简单的示例应用,展示了如何使用 nucleic_acid 插件进行核酸检测预约和查询:

import 'package:flutter/material.dart';
import 'package:nucleic_acid/nucleic_acid.dart';

void main() async {
  WidgetsFlutterBinding.ensureInitialized();
  await NucleicAcid.initialize();
  runApp(MyApp());
}

class MyApp extends StatelessWidget {
  [@override](/user/override)
  Widget build(BuildContext context) {
    return MaterialApp(
      home: Scaffold(
        appBar: AppBar(
          title: Text('核酸检测插件示例'),
        ),
        body: Center(
          child: Column(
            mainAxisAlignment: MainAxisAlignment.center,
            children: [
              ElevatedButton(
                onPressed: () {
                  bookNucleicAcidTest();
                },
                child: Text('预约核酸检测'),
              ),
              SizedBox(height: 20),
              ElevatedButton(
                onPressed: () {
                  queryNucleicAcidResult();
                },
                child: Text('查询核酸检测结果'),
              ),
            ],
          ),
        ),
      ),
    );
  }

  void bookNucleicAcidTest() async {
    try {
      var result = await NucleicAcid.bookTest(
        name: '张三',
        idCard: '123456789012345678',
        phone: '13800138000',
        location: '北京市朝阳区',
        date: DateTime.now().add(Duration(days: 1)),
      );
      print('预约成功: $result');
    } catch (e) {
      print('预约失败: $e');
    }
  }

  void queryNucleicAcidResult() async {
    try {
      var result = await NucleicAcid.queryResult(
        idCard: '123456789012345678',
        phone: '13800138000',
      );
      print('查询结果: $result');
    } catch (e) {
      print('查询失败: $e');
    }
  }
}
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